2009至2011年，重慶全面提高清潔能源使用率，有效改善了主城區的能源結構，改善了主城區大氣環境質量。全市清潔能源使用率均達到國家“十一五”環境保護模范城市考核指標“城市清潔能源使用率≥50%”的考核要求。

大力推進清潔能源工程。燃煤曾是重慶主城區大氣污染的主要來源，燃煤清潔能源改造是控制燃煤污染的最具根本性的措施。2000年初到2001年6月，重慶在主城區113個街道（鎮）范圍內全面推行清潔能源工程，將1153臺10蒸噸/小時以下的鍋爐和和1500臺茶水爐（大灶）全部改用清潔能源。2003—2004年，又對主城區445臺工業爐窯實施改造。其中2125臺燃煤爐窯實施清潔能源改造，230臺實施技術改造治理或關停、搬遷。2009年，重慶市政府辦公廳印發了《關于印發重慶市主城各區燃煤設施清潔能源改造實施方案（2009-2010年）的通知》。2000年，重慶在主城區開展第一階段燃煤清潔能源工程的基礎上，又啟動實施了第二階段清潔能源改造工程。重慶主城區清潔能源改造總投資40億元，完成了主城區所有10蒸噸/小時及以下燃煤鍋爐和茶水爐清潔能源改造，每年削減燃煤200多萬噸。

開展無煤系列創建工程。2005年以來，重慶在全市開展創建無煤區和基本無煤區工作，制訂了《重慶市無煤區和基本無煤區的創建標準》，并建立了無煤區管理長效機制。2009年，重慶在全國率先開展整區創建無煤區工作，渝中、江北、北碚、渝北、北部新區建成區已完成整體創建無煤區工作。2012年底又完成沙坪壩區、九龍坡區、大渡口區、南岸區、巴南區等整體建成無煤區工作。全市累計建成無煤區社區636個，主城區創建成無煤區面積530平方公里，關停取締燃煤設施3604個，年減少燃煤7萬噸，減少二氧化硫排放3920噸、煙塵5300噸。

積極開發利用天然氣。近年來，重慶市政府將發展天然氣作為全市的民心工程和綠色能源工程，大力開拓天然氣市場，建設天然氣儲配站和管網。2009-2011年，該市實施了江北區頭塘60萬立方米儲氣工程、低壓天然氣管網改造工程以及兩江新區天然氣管網配套工程等，三年完成天然氣管道建設1500公里，新增儲氣能力65萬立方米，完成投資15億元。新發展天然氣居民用戶37萬戶，新增企業和商業用戶5300戶，截至2011年底，居民用戶數達310萬戶，企業和商業用戶數達3萬戶。

加強外購電力保障力度。為減少主城區的電煤用量，近年來，重慶加大外購電的力度，實現了陜西向重慶點對網供電，大幅減少了電煤用量，減少了二氧化硫排放量。2010年補貼3億元，2011年補貼12億元用于外購煤電補貼，2011年確保外購電達到145億千瓦，同比增加20億千瓦時，年減少發電用煤110萬噸。

大力發展CNG汽車。近年來我市將公交(出租車)行業作為重慶市發展使用CNG（壓縮天然氣）汽車的重點領域，積極發展公交、出租CNG汽車。目前全市公交、出租行業CNG汽車總量達到7萬余輛，基本實現了將CNG作為公交(出租車)行業汽車燃料的目標。為確保CNG汽車能夠加好氣，保障公交系統的營運安全，市政府千方百計持續增加CNG供應量，全市CNG汽車的天然氣消費量由2008年底的5億立方米，增加到2011年底的近7億立方米。同時，加大CNG加氣站及其配套設施的建設。截止2011年底，全市建成投運94座加氣站，其中主城區加氣站累計達到60座，加氣能力175萬立方米/日。加快推進引進LNG補充CNG建設工作，在管道供氣不足或CNG加氣高峰時段，利用LNG進行氣源補充，目前已改造建成L-CNG加氣站兩座。

不斷提高燃油品質。在2008年之前，重慶主要使用10號柴油和90號汽油。截至2011年，0號柴油和93號清潔汽油已經基本替代原10號柴油和90號汽油，同時增加了-10號柴油和97號汽油的供應，有效降低了燃油對城市環境造成的污染。

落實建筑節能標準，極力開發利用可再生能源。重慶編制發布了《居住建筑節能50%設計標準》、《居住建筑節能65%設計標準》、《公共建筑節能工程施工質量驗收規程》、《居住建筑節能檢測標準》等50項建筑節能地方標準和圖集，形成了設計標準、施工驗收規程、標準設計齊全配套的技術法規體系，對建筑節能工作實施全過程監管提供了技術支撐。同時在全國率先實施了建筑節能初步設計專項審查和建筑節能設計質量自審責任制，對新建建筑強制執行建筑節能標準，督促設計單位切實提高建筑節能設計質量。截至目前，已在主城21個大型聚居區域建成綠色生態小區28個，建筑面積約490萬平方米。三年來，全市范圍內共開展建筑節能初設審查項目4313個，建筑面積約為1.84億平方米。并在主城區2737平方公里范圍內的新建居住建筑全面執行建筑節能65%標準，城鎮新建建筑執行節能強制性標準的比例達到96%，建筑領域形成節能能力約為150萬噸標準煤，有效降低了全市單位GDP能耗。

清潔能源的推廣和使用，不僅促進了循環經濟的發展，而且改善了城市環境質量和提高了人居生活水平，2009-2011年，重慶市主城區清潔能源使用率分別為84.86%、85.14％、85.9％，均達到國家規定的“城市清潔能源使用率大于50%”的考核要求。