今年上半年雨量充沛，良好的氣候條件并未有效推進小水電的良好發展，多個省份的小水電企業協會負責人反映，小水電企業頻頻告虧，投資人爭相轉手。一位小水電負責人表示，小水電企業的成本高于電價，發電越多賠的越多，虧損運營無法繼續。

專家分析稱，低電價只是影響企業盈虧的重要原因之一，而小水電管理體制不順，優惠政策難以落實等因素制約了行業的健康發展。

小水電作為一種重要的發電方式，對于電網公司暫時照顧不到的偏遠山區、農村的供電具有重大意義，在提供農村可用能源、防洪灌溉、就業等方面都有積極作用，甚至已經發展成為當地支柱性產業。

截至2008年年底，全國已建成5萬千瓦裝機以下的農村水電站4.5萬座。如此龐大的小水電群體卻面臨著多頭管理的問題，管理主體的模糊不僅使得管理體制不順管理，也導致了小水電的無序發展，在水電開發利用的大省，"炒電"熱潮過后，小水電企業普遍出現虧損運營的狀況。

2006年，八部委661號文件提出了水電全額上網同網同價以及優先上網的優惠政策，但這些優惠政策并沒有被有效的執行。與此同時，之前被視為小水電發展利好的"三自"方針、"小水電要有自己的供電區"、"小水電實行'以電養電'"、低增值稅、優先提供政府貸款、調節性能好和實現流域梯級開發的項目優先立項審批等優惠政策，已經幾乎全部失去了可操作性和有效性。