海納小分隊在2015年全國兩會上獲悉，四川方面已經就重慶小南海水電站項目表達了“反對”意見。

其中主要的反對方，是和重慶“一衣帶水”的瀘州和宜賓市。瀘州市長劉強認為，小南海工程將造成瀘州港區泥沙淤積，使得瀘州港成為“死港”。宜賓市市長徐進亦表達了同樣態度。

不過上述言論是兩位市長在參加全國兩會人大兩會小組討論時表達的，會后劉強拒絕了海納小分隊進一步采訪的意見，僅表示“在會上說說便好，不愿進一步公開矛盾”。

公開資料顯示，長江小南海水電工程位于重慶市巴南區中壩島，工程計劃總投資約320億元，電站裝機200萬千瓦，若項目建成，將成為重慶投資最大、裝機規模最大、發電量最大的水電項目。

重慶至該項目起始，便表達了積極推動意愿。2012年小南水電站“三通一平”奠基儀式上，黃奇帆等眾重慶領導到場。但此后該水電站并未實質開工，而是被環保部緊急叫停，至今仍未有后續進展曝出。

但重慶仍在推進小南海工程。目前受該工程影響的九龍坡區、江津區、巴南區正在進行移民安置規劃報告編制工作。

據國內媒體報道，整個小南海水電站的建設爭議持續了十多年，最根本的爭議是項目將人為分割長江上游珍稀特有魚類國家級保護區(重慶段)，影響長江珍稀特有魚類的繁衍生息。

“修建小南海水電站最直接的影響是，阻斷了壩下18公里實驗區與壩上魚類保護區其他江段的聯系，削弱了三峽水庫對保護區魚類的補充作用;間接影響則是壩上將形成47公里的水庫淹沒區，河流型生態環境將向水庫型生態環境轉變，該江段的原有功能將會發生一定的改變。”

重慶方面認為，小南海工程建設將緩解電力緊張局面、改變川江河段航道條件、減少主城港區泥沙淤積，解決渝西地區工程性缺水問題。

但四川方面卻有不同聲音，因為隨著長江經濟帶規劃的出臺，四川有意在重慶港上游新建“長江上游航運物流中心”，并希望獲得國家認可，其目的是聯合瀘州和宜賓港的力量，增強四川在內河港口上的優勢。

但該航運物流中心并未獲得國家的認可，但宜賓市市長徐進卻對海納小分隊表示，無論國家是否認可，該中心依然將會繼續進行下去。

但是在四川積極建設該航運物流中心的同時，最關鍵的阻礙來自于瀘州至重慶航道的暗礁險灘較多，目前瀘州方面正在積極的測算用爆破方式疏通河道的可能性。

但如果重慶小南海項目竣工，四川方面擔憂由于大壩的阻礙，不僅將影響通航，其次還會因為水流被截斷使得泥沙在四川境內河道淤積，從而進一步降低四川開發長江航道的可能性。